基于分子對接的虛擬篩選
▲ 基于分子對接的虛擬篩選
基于分子對接的虛擬篩選技術原理簡介 分子對接是一種基于靶標蛋白三維結構的藥物篩選方式。通過小分子化合物與靶標進行分子對接,綜合分析得分及空間構象情況,包括靜電作用、氫鍵作用、疏水作用、范德華作用等性質,可以探索配體小分子與受體生物大分子具體作用方式和結合構型,解釋化合物產生活性的原因,為合理地優化化合物結構提供指導;通過結合親合性打分函數,小分子化合物與靶蛋白的結合能力可以定量地得到評價,為候選化合物的挑選捉供依據,篩選潛在活性化合物,為實驗提供參考。基于分子對接的小分子化合物的虛擬篩選是目前較有潛力的藥物開發工具,由于分子對接過程對化合物結構并沒有限制,基于分子對接的虛擬選完全有可能獲得結構新穎的先導化合物。可以有效的節約時間和費用,這對于發展創新藥物無疑起到積極的推動作用
適用范圍 分子對接:運用AutoDock Vina進行蛋白-小分子、蛋白-蛋白的分子對接,綜合分析空間構象。
小分子藥物篩選:基于分子對接,對海量的小分子進行個性化的虛擬篩選,提高先導化合物的命中率。


