TurboID
▲ TurboID鄰近標記技術(shù)原理圖
TurboID鄰近標記技術(shù)原理簡介 TurboID是一種新的生物素連接酶,它可以將生物素轉(zhuǎn)化為一種共價標記近端蛋白質(zhì)的反應性中間體,進而將鄰近的蛋白質(zhì)標記上生物素。與BioID使用的生物素連接酶相比,TurboID的催化活性得到大大提升(標記時間從18 hrs縮短至10 min),從而大大的提高了標記效率。
TurboID鄰近標記(Proximity labeling, PL)的原理是將TurboID生物素連接酶與誘餌蛋白融合,當誘餌蛋白與靶標蛋白發(fā)生互作時,TurboID生物素連接酶通過催化的共價修飾將鄰近的蛋白標記上生物素,最后通過親和素磁珠富集生物素標記的蛋白進行質(zhì)譜鑒定,從而獲得靶標蛋白信息。蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions, PPIs)是細胞生命活動的基礎。傳統(tǒng)的體內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用捕獲技術(shù)如親和純化-質(zhì)譜技術(shù)(AP-MS),不能有效地捕獲瞬時的或較弱的蛋白相互作用,也不適用于低豐度的蛋白或疏水性較強的膜蛋白,且無法分辨蛋白相互作用發(fā)生的細胞區(qū)室化信息,存在較多的限制。然而,許多重要的信號轉(zhuǎn)導蛋白如受體激酶以及細胞譜系發(fā)生的驅(qū)動因子往往具有上述特征,這很大地限制了我們對于細胞活動精細調(diào)控過程的認識。
TurboID鄰近標記技術(shù)就可以克服以上的一些難題,在研究低豐度蛋白的互作蛋白組以及稀有、瞬時細胞類型的細胞、亞細胞蛋白組方面相比傳統(tǒng)AP-MS都有明顯的優(yōu)勢。
傳統(tǒng)IP-MS和酵母雙雜交技術(shù)的弊端:
①酵母屬于低等的真核生物,相比高等生物而言,其互作關(guān)系與真實的體內(nèi)互作關(guān)系相差較大;
②不能有效地捕獲瞬時的或較弱的蛋白相互作用;
③不適用于低豐度的蛋白或疏水性較強的膜蛋白;
④酵母體系依賴高質(zhì)量的cDNA文庫,而且假陽性較高;
TurboID鄰近標記技術(shù)技術(shù)優(yōu)勢 ①可以捕獲瞬時的或較弱的蛋白相互作用;
②適用于低豐度的蛋白或疏水性較強的膜蛋白的互作;
③在目標生物體內(nèi)獲得的互作情況可信度高,假陽性低;
④可以在佳的生理狀態(tài)下獲得的靶標蛋白的信息;
⑤即使瞬時互作的蛋白發(fā)生了轉(zhuǎn)移,但由于靶標蛋白仍保留了生物素化的特征,也能通過TurboID鄰近標記技術(shù)識別檢測,不被細胞區(qū)室化所影響。
TurboID鄰近標記技術(shù)服務范疇 ①研究蛋白與蛋白的相互作用;
②尋找目標激酶或者激酶的底物,用于瞬時互作或者弱互作蛋白的篩選;
③用于低豐度的蛋白或疏水性較強的膜蛋白的篩選;
④揭示目的蛋白在體內(nèi)的互作景觀;
TurboID鄰近標記技術(shù)服務周期 根據(jù)基因、細胞特性以及服務目的的不同,服務周期在4~6周。
服務流程 合同簽訂>預付款支付>提供靶細胞或者植物(我司現(xiàn)有的不需要提供)>項目啟動>實驗開展(定期匯報進度)>實驗結(jié)束>支付尾款,完成項目交付。
服務優(yōu)勢 ①團隊經(jīng)驗豐富;
②密切跟進實驗進展,積極主動匯報進展;
③根據(jù)客戶需求提供客戶項目的相關(guān)數(shù)據(jù)以及分析的結(jié)果;
④提供實驗詳細記錄,確保實驗數(shù)據(jù)真實可靠。


